农业与水利工程学院团总支是由大会民主选举产生，共有42个团支部、1011名团员。组织设有书记一名，副书记一名，主要负责组织工作的统筹安排以及对下设部门的管理。下设部门包括宣传部、组织部、社团部、社会实践部、综合事务部等。团总支自产生以来，一直实行集体领导和个人分工负责相结合的原则，始终坚持以思想引领为首要任务，加强青年思想建设。在2021年建党一百周年之际，利用线上微信平台为媒介以“学党史，知党情，跟党走”为主题诵读红色经典，宣讲党的光辉历程，提高团员青年的思想政治觉悟，开展活动200余次，关注量7680人次，共转发链接上万次。其中，以“学党史，颂党绩”为主题的党史知识竞赛活动，在各大平台报道。“五个关爱”、“世界水日”、“世界气象日”、“世界粮食日”等活动属于特色活动。通过与绥化市长江小学、张维镇中心校、朝阳社区、绥化市气象局、绥化市水务局取得联系联合举办各项活动增添组织风采，发扬组织精神。农业与水利工程学院团总支一直以团结协作、尽职尽责的态度积极有效的组织各项有益于大学生的活动，凝心聚力，加强精神文明建设，进一步坚定团员青年永跟党走的决心和信心。